在魚缸中種植水草、水面放入浮萍、無根萍...等綠色植物，可讓魚缸生態更趨近於原生自然環境生態。
人工飼養模式，是將魚隻排泄物與飼料殘餌，會排放含有劇毒氨氮，在時經過各種細菌分解管道後，降低有毒物質危害魚隻，進而達到生態平衡。
1.被附著在多孔性材料上的硝化菌群，將氨氣釋放的有毒物質，分解為亞硝酸鹽及硝酸鹽，最後成為植物吸收，同時，也揮發在空氣中。
2.由水生植物吸收轉換成植物細胞。
3.經分解型菌類分解。
存在水中的氨（阿摩尼亞，NH3/NH4+），會隨著魚隻不斷排泄及飼料殘餌增加而增加，若沒有完整的硝化菌系統，不會被轉化為亞硝酸鹽（NO2-）及硝酸鹽（NO3-），水中的魚蝦完全無法承受毒害而死亡，若有硝化菌群分解，及水生植物的吸收，自然地，對魚蝦的毒害也不會加大。
許多魚友過度著重於利用生化棉、陶瓷環...等各種培菌濾材，認為硝化菌群只會附著在這些濾材中，事實上，硝化菌數量最多處，並不是存在濾材上，而是底砂、底土表面層，硝化菌必須要有附著物附著，再藉由水流動獲取「食物」及「移動」，而水生植物的根、莖、葉...等，都是硝化菌群可附著處，換句話說，水生植物愈多，硝化菌群可附著地方也愈多。
大多數魚友種植水生植物多半會鋪設底砂，這層底砂對許多魚友來說，是麻煩又頭痛的負擔，但對魚隻及水質的穩定，卻是不可多得的利器。
這一底砂、底土層，從表面到底部，存在太多養魚必須要有的益菌群外，更可種植水生植物，好處相當多！
1.水生植物
植物的根部需要植床附著與伸展，底砂、底土層正是最好的附著物，同時，魚隻排泄、飼料殘餌及有機雜質，被分解細化後，可提供植物生長所需的元素及營養來源。
2.硝化菌
硝化菌群除集中在過濾器培菌濾材中外，在底砂、底土的表面淺層亦是硝化菌群最密集處，因水的流動，帶來了較充足的氧氣、分解物（食物），提供硝化菌繁衍所需的：環境、食物與氧氣三要素，若採用珊瑚砂等做為底砂層，珊瑚砂表面密佈無數細微孔隙，成為硝化菌群最佳的「家」。
3.分解型菌群
除大多魚友較為熟悉的硝化菌群外，分解型益菌群（如：光合菌群，簡稱PSB、消化菌群）亦是養魚不可少的益生菌，其中，可在厭氣環境下利用光能進行光合作用的光合菌群，正可利用底砂層底土層產生的硫化氫（H2S），及沉底細微的有機物做為供氫體，以CO2或有機物做為碳源，其主要功效之一，就是淨化水質，這也是為何，有鋪設底砂、底土的養殖槽水更易清澈的主因之一。
許多水草、浮萍類...等水生植物，同時也成為魚隻最佳的天然食物，除水草魚缸較密集的種植，需要添加多種不同的水草液肥，及充足的光照外，金魚、錦鯉魚...等觀賞魚，具有主動啄食水草習性，種植水生植物，不僅有助於水質淨化，又可成為魚隻最佳的天然餌料。
水生植物也是最佳的過濾高手，魚隻提供植物生長所需的元素與營養，透過植物的吸收與分解，提高水中含氧量，又達到淨化水質目的。若你是從田園、溪流...等處移植的水生植物，植入魚缸前，務必先做好清洗及消毒工作，避免病菌、寄生蟲或蝸牛，藉由植物入侵你的魚缸、導致魚隻染病。
建議你，不妨可在魚缸種植許多水生植物，透過植物的幫忙，讓你的魚更健康、水更乾淨！
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